根據(jù)《中共江蘇省委辦公廳、江蘇省人民政府辦公廳關(guān)于印發(fā)〈南京市人民政府職能轉(zhuǎn)變和機(jī)構(gòu)改革方案〉的通知》（蘇辦〔2014〕59號(hào)）和《中共南京市委、南京市人民政府關(guān)于印發(fā)〈南京市人民政府職能轉(zhuǎn)變和機(jī)構(gòu)改革實(shí)施意見〉的通知》（寧委發(fā)〔2015〕4號(hào)）規(guī)定，設(shè)立市水務(wù)局，為市政府工作部門，承擔(dān)全市水行政管理工作責(zé)任。其主要職責(zé)是：（一）貫徹國(guó)家和省有關(guān)水行政法律、法規(guī)和方針政策。研究起草全市水務(wù)行業(yè)地方性法規(guī)、規(guī)章并監(jiān)督實(shí)施，實(shí)行依法治水、依法管水。（二）研究擬定全市水務(wù)發(fā)展戰(zhàn)略和政策、水務(wù)中長(zhǎng)期規(guī)劃、年度計(jì)劃。負(fù)責(zé)研究擬定市域主要江河、湖泊和流域（區(qū)域）綜合規(guī)劃及水資源保護(hù)、防洪、供水、節(jié)水、排水、生活污水處理、水土保持和農(nóng)田水利等專業(yè)規(guī)劃，并監(jiān)督實(shí)施；組織有關(guān)國(guó)民經(jīng)濟(jì)總體規(guī)劃、城鄉(xiāng)規(guī)劃及重大建設(shè)項(xiàng)目中水資源和防洪等水務(wù)論證工作；指導(dǎo)各區(qū)水務(wù)規(guī)劃編制工作。（三）負(fù)責(zé)全市水資源的統(tǒng)一管理和保護(hù)。組織擬定全市和跨區(qū)中長(zhǎng)期水量供求計(jì)劃和分配方案并監(jiān)督實(shí)施；組織水功能區(qū)的劃分和管理；負(fù)責(zé)水域的納污能力和限制排污總量的核定工作，提出限制排污的總量建議；指導(dǎo)飲用水水源保護(hù)工作；負(fù)責(zé)全市計(jì)劃用水、節(jié)約用水工作；組織實(shí)施取水許可制度和水資源有償使用制度；組織實(shí)施河湖引調(diào)水工作；指導(dǎo)再生水等非傳統(tǒng)水資源開發(fā)利用工作；負(fù)責(zé)全市地表水、地下水開發(fā)利用和管理保護(hù)工作。承擔(dān)全市最嚴(yán)格水資源管理制度考核工作。（四）負(fù)責(zé)全市供水管理工作。監(jiān)督、檢查、考核全市供水規(guī)劃及年度計(jì)劃執(zhí)行、服務(wù)指標(biāo)和供水設(shè)施的管理維護(hù)工作；負(fù)責(zé)供水特許經(jīng)營(yíng)管理。（五）負(fù)責(zé)全市排水管理和生活污水處理、再生水利用管理工作。組織實(shí)施排水許可工作。組織實(shí)施排水達(dá)標(biāo)區(qū)創(chuàng)建工作和雨污分流改造工作。監(jiān)督、檢查、考核排水、生活污水處理規(guī)劃及年度計(jì)劃執(zhí)行情況和設(shè)施的運(yùn)行、維修養(yǎng)護(hù)情況；負(fù)責(zé)生活污水處理、再生水利用行業(yè)特許經(jīng)營(yíng)工作；負(fù)責(zé)污水處理費(fèi)征收和使用管理工作。（六）負(fù)責(zé)組織指導(dǎo)全市水行政執(zhí)法工作。協(xié)調(diào)處理部門之間、各區(qū)之間以及相鄰地區(qū)間的水事糾紛；依法查處違反水法律、法規(guī)和規(guī)章的水事案件。（七）承擔(dān)本行政區(qū)域內(nèi)長(zhǎng)江采砂執(zhí)法管理和監(jiān)督檢查工作。負(fù)責(zé)審查從事長(zhǎng)江采砂活動(dòng)的單位和個(gè)人的申請(qǐng)，并報(bào)上級(jí)水行政部門審批；牽頭負(fù)責(zé)其他河道采砂監(jiān)督管理工作。（八）負(fù)責(zé)全市城鄉(xiāng)河道、湖泊、水庫(kù)、塘壩及其水域、岸線以及堤壩、涵閘、泵站、灌區(qū)、溝渠等各類水務(wù)工程設(shè)施的管理與保護(hù)。（九）負(fù)責(zé)全市農(nóng)村水利工作，組織協(xié)調(diào)農(nóng)田水利建設(shè)。指導(dǎo)全市機(jī)電排灌、灌區(qū)改造與節(jié)水灌溉和農(nóng)村河道疏浚整治工作；指導(dǎo)全市農(nóng)田基本建設(shè)中水利方面的工作以及丘陵山區(qū)小流域治理工作；指導(dǎo)全市農(nóng)村水利服務(wù)體系建設(shè)。（十）負(fù)責(zé)組織指導(dǎo)全市水土保持工作。研究制定水土保持規(guī)劃并監(jiān)督實(shí)施；組織水土流失的監(jiān)測(cè)和綜合防治；負(fù)責(zé)并指導(dǎo)開發(fā)項(xiàng)目的水土保持工作的監(jiān)督和管理。（十一）負(fù)責(zé)全市水務(wù)工程建設(shè)管理。組織實(shí)施國(guó)家、省水務(wù)工程相關(guān)技術(shù)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)程、規(guī)范，起草地方相關(guān)工程建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)并組織實(shí)施；組織建設(shè)和管理具有控制性的或跨區(qū)的重要水務(wù)工程；負(fù)責(zé)組織和協(xié)調(diào)城鄉(xiāng)建設(shè)中涉及水務(wù)設(shè)施的配套工作；負(fù)責(zé)水務(wù)工程建設(shè)和運(yùn)行的質(zhì)量與安全監(jiān)管工作；負(fù)責(zé)水務(wù)工程建設(shè)項(xiàng)目招標(biāo)、投標(biāo)活動(dòng)的組織監(jiān)督管理工作。（十二）負(fù)責(zé)全市水務(wù)科技信息工作。組織重大水務(wù)科學(xué)技術(shù)研究、推廣與應(yīng)用；負(fù)責(zé)國(guó)內(nèi)外先進(jìn)技術(shù)的引進(jìn)、消化與吸收；負(fù)責(zé)水務(wù)行業(yè)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)程規(guī)范的監(jiān)督與實(shí)施，并補(bǔ)充與完善；負(fù)責(zé)全市水務(wù)行業(yè)對(duì)外技術(shù)合作與交流；指導(dǎo)全市水務(wù)信息化工作。（十三）負(fù)責(zé)編制全市水務(wù)年度建設(shè)資金計(jì)劃并組織實(shí)施。負(fù)責(zé)市本級(jí)水務(wù)建設(shè)資金的管理使用；負(fù)責(zé)提出有關(guān)水務(wù)價(jià)格、收費(fèi)、稅收、信貸、財(cái)務(wù)等方面的意見；負(fù)責(zé)市水務(wù)局系統(tǒng)國(guó)有資產(chǎn)的監(jiān)督管理工作；指導(dǎo)全市水務(wù)系統(tǒng)財(cái)務(wù)、內(nèi)部審計(jì)工作。（十四）負(fù)責(zé)組織、協(xié)調(diào)、監(jiān)督、指導(dǎo)全市防汛防旱防臺(tái)排水防澇工作。負(fù)責(zé)對(duì)流域性河湖、城鄉(xiāng)骨干河道和主要水務(wù)工程設(shè)施實(shí)施防汛抗旱防臺(tái)排水防澇調(diào)度，負(fù)責(zé)市防汛防旱指揮部的日常工作及防汛指揮調(diào)度應(yīng)急處置等工作。（十五）承辦市政府交辦的其他事項(xiàng)。